病原生物学( 40

学科带头人:吕刚

学科类型:校级重点学科

简介: 病原生物学是基础医学下设的二级学科,部分院校可颁发理学学位。病原生物学是研究与疾病有关的微生物(包括病毒、细菌、立克次体、衣原体等)和寄生虫(包括原虫、蠕虫、医学节肢动物)的生物学规律、致病机理及其与宿主之间相互作用的科学,是基础医学中极为重要的学科。随着社会经济的发展、东西方文化的交流、人类生活的改善和和行为方式的改变以及环境、气候的变化,人类感染性疾病的“病原谱”也发生了重大变化,加上病原体对抗生素耐药性的产生和新的病原体因子的发现,人类仍面临着与病原生物斗争的严峻挑战。

中文期刊(39
  • 计算机图像分析技术在胸水腺癌细胞和反应性间皮细胞鉴别中的应用 作者:牛海艳,蓝永洪,饶朗毓,杨智(海南医学院病理学教研室暨海南医学院附属医院病理科;海南医学院病理学教研室暨海南医学院形态学实验室;海南医学院病理学教研室暨海南医学院形态学实验室;海南医学院病理学教研室暨海南医学院病原生物学教研室) 出处:中华病理学杂志2015P 关键词:  计算机图像分析技术  胸水腺癌细胞  反应性间皮细胞  细胞鉴别  应用  色度学参数  reactive  判别符合率   摘要:能够快速而准确地对胸水中脱落细胞做出良恶性判断,是目前临床对病理医师的迫切要求。在致病因子刺激下,大量增生的反应性间皮细胞( reactive mesothelial cell, RMC)脱落到胸水中与腺癌细胞( adenocarcinoma cell, ACC)形态相似,单靠显微镜通过肉眼观察很难做出正确的诊断[1]。计算机医学图像处理与分析技术通过对细胞形态、组成成分等进行定量分析,在临床诊断和研究工作中越来越多的得到实际应用[2],其中细胞形态结构和颜色的变化[3]无论在主观观察还是在定量分析中都是重要的参考指标。我们前期的研究结果显示,基于全细胞色度学参数所建立函数的判别符合率明显优于细胞质和细胞核色度学参数,并且与结合细胞质和细胞核色度学参数所建立函数的符合率相当[4-5],提示全细胞的色度学参数综合了细胞质和细胞核的色度学特点,更能反映ACC的色度学特征,对于胸水中ACC和RMC的分类与判别更具有鉴别价值,但是其判别效果仍不理想,考虑是否引入形态学参数,在不同形态学参数分类下进行判别分析,探索全细胞色度学参数的应用范围。因此我们借助计算机图像分析技术对巴氏染色胸水ACC和RMC的细胞核和细胞质面积进行定量测试,计算核质比( nuclear ;to cytoplasmic ratio,Rnp ),比较不同Rnp中基于全细胞色度学参数所建立函数在胸水ACC的判别符合率,探讨全细胞色度学参数在不同Rnp对胸水ACC临床病理诊断分类的价值,从而为临床计算机自动识别细胞的应用奠定基础。
  • 细粒棘球绦虫GAPDH蛋白的生物信息学分析及其重组表达纯化和酶活性检测 作者:吴巨龙,王绚,吕刚,苏娟,逯召莲,孙萃萍,景涛(兰州大学基础医学院病原生物学研究所;海南医学院寄生虫学教研室;甘肃省新药临床前重点实验室)(兰州大学基础医学院病原生物学研究所;海南医学院寄生虫学教研室;甘肃省新药临床前重点实验室) 出处:中国人兽共患病学报2014P 关键词:  细粒棘球绦虫  甘油醛3  磷酸脱氢酶  生物信息学  原核表达  酶活性检测   摘要:目的以生物信息学预测细粒棘球绦虫甘油醛3-磷酸脱氢酶(EgGAPDH)编码基因及其编码蛋白的结构和功能,利用大肠杆菌原核表达系统高效表达EgGAPDH重组蛋白,体外检测其酶活性。方法运用各软件对EgGAPDH的理化性质、保守功能域、系统发生树和二级结构、三级结构等方面进行分析后,将EgGAPDH基因亚克隆于表达载体pET30a(+),转化入E.coli BL21(DE3)感受态细菌,表达、纯化重组蛋白,并利用底物3-磷酸甘油醛测定重组蛋白EgGAPDH的酶催化活性。结果 EgGAPDH cDNA序列长度为1 011bp,编码一个336个氨基酸的蛋白。该GAPDH蛋白理论相对分子质量为36 128.3Da,等电点为8.44,具有GAPDH蛋白家族的两个功能结构域,富含6种类型的特定功能位点。成功构建的原核表达载体pET30a(+)-EgGAPDH在E.coli BL21(DE3)中高效表达,且发现表达产物主要以可溶形式分布于裂解上清,制备甘油醛3-磷酸脱氢酶纯品并通过酶活检测显示其具有高效酶活性。结论 EgGAPDH基因可在原核系统中获得有酶催化活性的高效表达,为进一步研究其在糖代谢中的功能奠定了基础。
  • 数字摄像头和生物显微镜对显微图像定量分析的影响 作者:陈锦龙,李精秀,蓝永洪(海南医学院病原生物学教研室;海南医学院形态学实验室)(海南医学院病原生物学教研室;海南医学院形态学实验室) 出处:中国医药导报2014P 关键词:  显微图像定量分析  数字摄像头  生物显微镜   摘要:目的探讨数字摄像头和生物显微镜对显微图像定量分析的影响情况。方法以物镜测微尺为研究标定,将不同数字摄像头安装同一生物显微镜(不同摄像头组)和同一数字摄像头安装不同生物显微镜(不同显微镜组)后对测微尺进行摄像,应用图像分析软件分别测试不同测微尺图像每微米所代表的像素值,并对测试结果进行分析比较。结果 CX31显微镜下DPIXEL200、DP520DC、MD20、YM310和DP26所摄取的测微尺图像每微米所代表的像素值分别为(2.398±0.011)、(5.217±0.019)、(4.770±0.012)、(4.764±0.020)和(4.437±0.023),差异有高度统计学意义(P0.05)。结论数字摄像头对显微图像定量分析影响明显,而生物显微镜则影响不明显。
  • 1株不典型非O1群霍乱弧菌的发现及鉴定 作者:吴至成,覃西,伍丽娴,翟英超,王小娟,李影林(海口市海南医学院附属医院检验科;海口市海南医学院热带医学与检验医学院病原生物学教研室)(海口市海南医学院附属医院检验科;海口市海南医学院热带医学与检验医学院病原生物学教研室) 出处:中华医院感染学杂志2012P 关键词:  非O1群霍乱弧菌  肝硬化  不典型  鉴定   摘要:目的对1株从肝硬化患者血液中分离的病原菌进行鉴定。方法按霍乱弧菌的鉴定标准和方法进行细菌学表型特征(包括形态学、培养特性、生化特征)、血清学鉴定及16SrDNA序列分析。结果从患者血液中分离获得1株病原菌HN 9837,该菌株的形态学、培养特性、生化特征、血清学诊断和分子生物学诊断结果基本符合非O1群霍乱弧菌定义;但与普通霍乱弧菌在甘露醇发酵及赖氨酸利用、柠檬酸盐利用试验结果存在差异。结论海南省首次在肝硬化患者血液中分离出非O1群霍乱弧菌,该菌为1株不发酵甘露醇、赖氨酸且柠檬酸盐利用试验阴性的不典型霍乱弧菌。
  • 曼氏迭宫绦虫四次跨膜蛋白(SmTSP)的生物信息学分析 作者:梁培,吕刚,钟赛凤,甘秀凤,符瑞佳(海南医学院热带医学与检验医学院病原生物学教研室)(海南医学院热带医学与检验医学院病原生物学教研室) 出处:海南医学院学报2015P 关键词:  曼氏迭宫绦虫  四次跨膜蛋白  生物信息学分析  疫苗   摘要:目的:通过对曼氏迭宫绦虫的4次跨膜蛋白(SmTSP)潜在的生物学特征和参数进行分析,从而获得其具有的潜在生物学功能和应用价值。方法:利用美国国家生物技术信息中心(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(http://www.expasy.org/)提供的在线分析工具对编码蛋白的氨基酸序列的理化性质,跨膜结构和三维空间结构进行分析,同时利用Vector NTI suite和TreeView software生物信息分析软件进行编码氨基酸序列的相似性比对和进化树分析,利用CBS Prediction Servers BepiPred进行最大胞外环(LEL)的B细胞线性表位预测。结果:从文库中得到的SmTSP是全长基因,编码的蛋白是24.8kDa,理论等点为7.88,是一个稳定的蛋白分子。编码该蛋白的氨基酸序列共有4个跨膜区,分别是TM1aa16~38、TM2aa58~80、TM3aa87~109、TM4aa200~222。LEL中含有CCG结构、PXSC结构、GC结构和含有9个二聚体结合位点的保守特征结构。SmTSP全长序列与多房棘球绦虫、细粒棘球绦虫的相似性均能达到72%,但是与吸虫之间的相似性仅达到31%~59%,然而与人类相似性仅有23%,与小鼠的相似性最低,仅有17%。在进化树分析中,SmTSP与绦虫的亲源性在对比序列中是最近的,吸虫类次之,但是与埃及裂体吸虫和牛裂体吸虫、其他寄生虫(美洲钩虫和秀丽隐杆线虫)的亲源性相对较远,与哺乳动物亲源性最远。LEL有3个B细胞表位,分别是13aa~21aa、41aa~63aa和70aa~76aa。此外与人类四次跨膜蛋白的LEL中B细胞表位数量、分布的位置和编码的氨基酸都不同。结论:SmTSP可能是一个定位于虫体表膜并且具有应用前景的疫苗候选分子。
  • 具有免疫增强活性红树林真菌的分离及菌株WC1024的鉴定 作者:牛莉娜,林英姿,裴华,饶朗毓,吕刚,王英,陈锦龙(海南医学院热带医学与检验医学院病原生物学教研室) 出处:现代预防医学2012P 关键词:  红树林真菌  鉴定  疣孢青霉  免疫活性   摘要:目的对采自海南省文昌市清澜港红树林的土壤样品进行真菌选择性分离,对其发酵液进行免疫增强活性筛选,并对活性较好的菌株进行鉴定。方法利用四甲基偶氮唑盐(MTT)法检测菌株的免疫活性。通过菌落特征、显微形态、5.8SrDNA-ITS序列测定及其系统发育分析对菌株WC1024进行鉴定。结果共分离得到真菌104株,活性筛选得到阳性菌株5株。其中菌株WC1024发酵液粗提物可刺激人外周血单个核细胞增殖,具有较强的免疫增强活性。通过各种指标鉴定菌株WC1024为疣孢青霉(Penicillium verruculosum)。结论添加青霉素和链霉素的海水马丁培养基用于海洋真菌的分类培养具有很好的选择性,首次鉴定发现1株具有显著免疫增强活性的疣孢青霉。
  • 全细胞色度学分析在鉴别胸水腺癌细胞和间皮细胞中的作用 作者:牛海艳,蓝永洪,饶朗毓,江朝娜,杨智(海南医学院病理学教研室;海南医学院附属医院病理科;海南医学院形态学实验室;海南医学院病原生物学教研室) 出处:中国体视学与图像分析2014P 关键词:  胸水  腺癌  反应性间皮细胞  巴氏染色  色度学   摘要:目的定量观察和分析胸水涂片中腺癌细胞的细胞浆、细胞核和全细胞的色度学特征,筛选对判别ACC和反应性间皮细胞有参考价值的色度学参数。方法胸水离心后取沉淀物涂片、然后进行巴氏染色;在数码显微镜下拍摄图像,用计算机图像分析技术测量其中的764个ACC(44例)和709个RMC(39例)的色度学参数,包括细胞浆、细胞核和全细胞的红、绿、蓝三基色,并对测试结果进行判别分析,比较基于三种色度学参数所建立函数的判别效果。结果与RMC相比,ACC的细胞浆、细胞核和全细胞红、绿、蓝三基色明显减小(P<0.05)。基于以上三种色度学参数所建立函数的判别符合率分别为68.7%、59.4%和74.7%,其中基于全细胞色度学参数所建立的函数判别符合率明显高于基于细胞浆和细胞核色度学参数所建立函数的(P<0.05)。结论在胸水ACC的定量判别分析中,全细胞的色度学参数比细胞浆和细胞核可能更具有参考价值。
  • 人体寄生虫学实验课教学模式改革探讨 作者:范志刚,钟赛凤,甘秀凤,林琼莲(海南医学院热带医学与检验医学院病原生物学教研室;海南医学院热带医学与检验医学院病原生物学与免疫学实验室) 出处:中国病原生物学杂志2011P 关键词:  人体寄生虫学  实验教学  教学改革   摘要:将人体寄生虫学实验课授课方式由传统教师主讲型转变为学生主讲型,镜下学习形式由教师指导督促型转变为学生自主互助型,添加'镜下考核阶段'和'提问阶段';将成绩计分由一元计分制转变为多元计分制,并改变评分标准。教学模式改革后,相对于传统模式,74.74%的学生更喜欢目前新的授课形式,98.85%的学生认为自主学习能力、表达能力等得到提高;课前预习的学生人数增加了95%以上。人体寄生虫学实验课教学模式的改革有利于学生综合能力的提高和不良学习方式的改善。
  • 人体寄生虫学实验教学中手机应用的探索 作者:范志刚,符怀艺,常彩虹,钟赛凤(海南医学院病原生物学教研室;海南医学院附属医院住院部;海南医学院免疫学教研室;海南医学院病原生物学与免疫实验室) 出处:基础医学教育2015P 关键词:  人体寄生虫学  实验教学  手机  QQ  微信   摘要:在人体寄生虫学实验课教学中,教师经常遇到难以及时质控学生的学习状况和完全杜绝学生抄袭作业等问题。利用手机QQ和微信构建实验课堂学生学习质控和互动平台以及作业质控平台,以期及时解决这些问题,同时广泛分享学习内容,促进师生、生生互动,最终提高教学质量。
  • 海南医学院在校大学生蠕形螨感染状况调查分析 作者:钟赛凤,吕刚,甘秀凤,林琼莲,范志刚,芦亚君(海南医学院病原生物学教研室)(海南医学院病原生物学教研室) 出处:海南医学2013P 关键词:  蠕形螨  感染  透明胶带粘贴法   摘要:目的 了解大学生面部蠕形螨的感染情况,为大学生皮肤蠕形螨的预防提供指导性资料.方法 选取海南医学院2009级272名大学生为调查对象,使用透明胶带粘贴法进行面部取样,通过显微镜镜下观察,查到蠕形螨即为阳性结果,记录数据并进行统计学分析.结果 272名调查对象中阳性者69名,总感染率为25.37%,感染者以轻度感染者为主,占总感染人数的92.70%(P<0.01);感染蠕形螨类型以毛囊蠕形螨为主,其感染率为56.52%(P<0.01);蠕形螨感染率与学生生源地、性别及皮肤损伤情况无关(P>0.05).结论 蠕形螨感染可能与大学生的个人卫生和生活习惯因素有关.
中文会议论文(1
  • 一株不典型非O1群霍乱弧菌(海南株)的发现及鉴定 作者:吴至成,覃西,伍丽娴,李影林(海南医学院附属医院检验科;海南医学院热带医学与检验医学院病原生物学教研室) 出处:2012年海南省微生物学会学术年会2012 关键词:  非O1群霍乱弧菌  肝硬化  不典型  鉴定   摘要:目的对一株从肝硬化患者血液中分离的病原菌进行鉴定。方法按霍乱弧菌的鉴定标准和方法进行细菌学表型特征(包括形态学、培养特性、生化特征)、血清学鉴定及16S rDNA序列分析。结果患者血液中病原菌的形态学、培养特性、生化特征、血清学诊断和分子生物学诊断结果基本符合非O1群霍乱弧菌定义;但与普通霍乱弧菌在甘露醇发酵及赖氨酸利用、枸橼酸盐利用试验结果存在差异。结论海南省首次在肝硬化患者血液中分离出非O1群